হঠাত করে উদয় হওয়া জন হ্যারিসন(বেনেডিক্ট) নামের স্টারফ্লিটের টপ এজেন্টদের মধ্যে একজন; এক বছর আগেও সে কি করতো কেউ জানে না। সে স্ট্রারফ্লিট আর্কাইভে বোমা বিষ্ফোরন ঘটায়। এরপর উচ্চপদস্থ স্টারফ্লিট কর্মকর্তাদের মধ্যে হত্যাজজ্ঞ চালিয়ে পালিয়ে যায় ক্লিংগং গ্রহে। যারা আবার স্টারফ্লিটের প্রতিদ্বন্দী বা শত্রু। তাকে ধরতেই U.S.S এন্টার প্রাইজের ক্যাপ্টেন, জেমস ক্রিক যাত্রা করে। এখানেই কেচো খুড়তেই বেড়িয়ে আসে কালো সাপ।